《心經》的經文可分為三個部分，或者說，可把《心經》經文的全部句子分為三類：主題句、闡釋句和祈願句。

第一類是主題句，即《心經》開頭的句子。這些句子指出這部經的中心思想，也就是說明這部經要傳達一個什麼訊息。主題句是：

觀自在菩薩，行深般若波羅蜜多時，照見五蘊皆空，度一切苦厄。

接著第二類是闡釋句，即闡釋主題句的句子。《心經》大部分句子都屬此類。這又可分為兩個部分，一是闡釋主題句中的「（行深般若波羅蜜多時，）照見五蘊皆空」，即闡釋「空」義，這部分的句子是：

舍利子！色不異空，空不異色；色即是空，空即是色。受想行識，亦復如是。

舍利子！是諸法空相：不生不滅，不垢不淨，不增不減。

是故空中無色，無受想行識，無眼耳鼻舌身意，無色聲香味觸法，無眼界，乃至無意識界，無無明，亦無無明盡，乃至無老死，亦無老死盡，無苦集滅道，無智亦無得，以無所得故。

二是闡釋主題句中的「（行深般若波羅蜜多時，）度一切苦厄」，即闡釋解除一切苦的情況，這部分的句子是：

菩提薩埵，依般若波羅蜜多故，心無罣礙。無罣礙故，無有恐怖，遠離顛倒夢想，究竟涅槃。三世諸佛，依般若波羅蜜多故，得阿耨多羅三藐三菩提。

故知般若波羅蜜多，是大神咒，是大明咒，是無上咒，是無等等咒，能除一切苦，真實不虛。

最後第三類是祈願句，即《心經》末尾的咒語。通過這些咒語，可鼓勵或加持學佛修行者由此岸到達彼岸，這些句子是：

故說般若波羅蜜多咒，即說咒曰：揭諦揭諦，波羅揭諦，波羅僧揭諦，菩提薩婆訶。

據上所述，《心經》的經文結構，既明確又完整。